近日，基因組所所級中心基因組平臺三代單分子實時測序PacBio完成技術升級優化，實現了數據產量和讀長的雙重提升，一個SMRT Cell芯片可產出高達1Gb數據， reads平均長度達到14kb，N50超過19kb，為基因組學相關研究提供了有力支撐。

　　PacBio 測序read和subread長度分布 

　　利用三代單分子實時測序儀PacBio系統，平臺提供的技術支撐服務包括：

　　1.基因組de novo測序組裝 

　　PacBio測序read超長的特點，適合于基因組de novo組裝。例如一個5Mb大小的細菌基因組，只需一個SMRT Cell測序即可完成基因組finish，周期小于5天。對于復雜基因組,預期Contig N50超過100kb，推薦de novo組裝需50ⅹ以上的PacBio測序覆蓋，二代測序數據和PacBio測序數據混合組裝，推薦30ⅹ以上的PacBio測序覆蓋，如用于基因組scaffold構建，推薦10ⅹ以上的PacBio測序覆蓋。 

　　2.全長轉錄本測序 

　　受傳統測序技術短讀長的限制，較難獲得全長轉錄本序列。在PacBio測序平臺上，我們開發了全長cDNA測序和分析技術流程。PacBio測序產生的read長度遠大于絕大部分cDNA長度，因此無需經過后續序列拼接組裝，即可獲得準確全長cDNA序列，分析基因轉錄后可變剪切信息以及LncRNA表達等。 

　　3.堿基修飾檢測 

　　PacBio測序另一個優勢是可獲得DNA聚合酶促反應的分子動力學數據，分析堿基修飾信息。因為堿基基團修飾后的位阻作用，DNA聚合酶在帶有修飾堿基的核苷酸位置前后，表現出延滯效應，經計算分析得到IPD ratio差異,不同修飾的IPD ratio值不同，從而獲取堿基修飾信息。目前測序比較準確的修飾類型是m6A,另外5mC、5hmC、4mC等修飾信息也可得到，但需要特殊的樣品處理或數據處理。 

　　此外，基于PacBio系統，平臺還提供基因組BAC克隆混合測序、長擴增子測序、極端GC含量DNA測序等技術開發服務。