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                            基因組學“鑄槍師”

                              就像好萊塢英雄類題材電影中,完成一項特殊任務通常要集結擁有不同特長的各路強手一樣,研發一臺基因測序儀更是需要生物、半導體、光學、材料、自動化控制、圖像處理、機械工程、軟件工程等多個領域的聯合攻關。 

                               中科院北京基因組研究所基因測序儀研發團隊 

                              任魯風和他的同伴們這幾年心里最大的念想就是做一把“好槍”。在他們所處的基因組學研究領域中,測序儀的優劣就好比士兵在戰場上有沒有得心應手的槍。
                              我國是曾參與“人類基因組計劃”僅有的6個國家之一,近年來有關“中國完成某個物種基因組測序”的報道時常見諸報端,但光鮮背后難掩的尷尬卻是,我們始終難以擺脫對進口測序儀器的依賴。
                              “拿著別人造的槍,裝著買來的彈,打著別人打剩下的鳥。”中科院北京基因組研究所(以下簡稱基因組所)黨委書記楊衛平說,“沒有自己的儀器和測序技術,我們只能跟在別人后面走,根本談不上超越。”
                              做自己的測序儀
                              基因組所技術研發中心主任于軍認為,如果把基因組學比成一個交通系統,測序儀就是車——“我們如果連車都沒有,怎么跑?”
                              任魯風在擔任基因組所技術研發中心常務副主任之后,考慮最多的也是基因測序儀受制于人的問題。
                              近來基因檢測用于醫療健康最廣為人知的故事,便是美國影星安吉麗娜·朱莉通過基因檢測獲知自己患乳腺癌的幾率高達87%,從而預防性地進行了乳腺切除手術。
                              “可是目前國內市場上的主流基因測序設備及其配套試劑均依賴進口,據估計僅2013年我國在儀器和試劑上的投入就會消耗20億元。”任魯風說。
                              在此背景下,打造先進的國產基因測序儀器成了基因組所這支國家隊最重要的任務之一。
                              跨學科聯合攻關
                              就像好萊塢英雄類題材電影中,完成一項特殊任務通常要集結擁有不同特長的各路強手一樣,研發一臺基因測序儀更是需要生物、半導體、光學、材料、自動化控制、圖像處理、機械工程、軟件工程等多個領域的聯合攻關。
                              為此,基因組所邀請中科院半導體研究所加盟。在項目的籌備階段,雙方會定期聚在一起,相互學習對方的專業知識,為跨界合作進行儲備和磨合。
                               不僅如此,基因組所還向中科院電子所、計算所等多個相關科研機構尋求智力支持。已經退休的馮玉臣就被特邀出山,負責測序儀的機械結構設計和硬件集成。退休前,他是中科院電子所從事機械制造專業工作多年的高級工程師。
                              對于研發基因測序儀,任魯風之前的經歷似乎冥冥之中在為此作著準備。他的父親是光電子學研究者,他本人大學讀的是生物專業,曾在醫院的檢驗科工作,也在企業里負責過研發和投融資管理,可謂“雜家”。在于軍對科研方向的整體把握下,任魯風成為了測序儀研發各項具體事務的實際負責人。
                              在詳細論證后,科研團隊選擇正處于主流階段的第二代測序儀作為突破口。盡管對于聯合攻關的困難已有一定估計,但進入到實際操作階段,任魯風還是深深感到,想造一把基因測序的“好槍”著實不易。
                               “通過生化反應產生光學信號,然后進行圖像處理、軟件分析等等一系列復雜的過程都需要科學嚴密的設計和控制。”作為從總體到各個環節的負責人和協調者,任魯風必須熟悉每個步驟的實際工作。
                              任魯風覺得,自己必須從頭到尾做一遍,心里才有底。有的細節問題,在北京解決不了,他就和同伴跑到外地去解決,合作方不能很好滿足需要時,他們就會親自動手直至達到預期的標準。
                              此外,資金的限制也是一大難題。有人開玩笑說:“這是在用買一臺設備的錢來造一臺設備。”難度可想而知。
                              向量產進軍
                              盡管如此,這支團隊還是向最終目標一步步邁進,歷時兩年半時間完成了第二代測序儀研發項目,于2011年實現原理樣機和性能驗收,部分性能指標超越同類進口產品。
                              這是我國第一臺能夠達到國際主流設備技術指標的國產化第二代測序儀,且成本低于進口設備的1/2以上,應用成本低于進口設備的1/3以上。
                              此后,基因組所自主投入完成了該項目的工程化和產品化開發,并形成其自主知識產權集群。
                              對于基因組所的成果,時任中科院副院長李家洋特地發來的賀信中寫道:“很高興聽到這一令人振奮的好消息”,并且“完全贊成”將其進行產業化的想法。
                              為推進成果轉化,基因組所尋求商業力量介入,聯合上市公司紫鑫藥業共同推進測序儀的產業化。
                              事實上,此前他們就已經在人參基因組和中國人參資源普查等研究領域進行了多年的緊密合作。
                              作為這支基因測序“鑄槍師”團隊的重要成員,基因組所副研究員王緒敏對利用基因測序摸清人參資源的科考經歷記憶猶新。
                              這次調查歷時3個月,投入10輛采樣車,30余名科研人員,行駛2.5萬公里,途經21個縣市,97個鄉鎮,走訪近300個村屯,深入近1000塊參地,足跡遍布吉林省內所有人參產區,共采集各類樣本3萬余個,建成了國內首個人參物種種質資源庫。
                              在這一過程中,基因組所團隊成員楊伯陽腳踝受傷但沒有離隊,鄉下醫療條件差,傷病沒有得到及時深入的檢查,完成任務回京后才發現是跟腱斷裂補做了手術;有的年輕隊員則為堅持做完整個調查項目而修改了此前定好的婚期。
                              雖然經歷了各種困難,但率隊參與這次調查的王緒敏和任魯風都感到,基因組所和企業之間的信任和默契也因此逐漸建立起來了。
                              在前不久召開的國際基因組學大會上,基因組所和紫鑫藥業就合作開發第二代高通量測序系統項目正式簽訂了投資意向協議。雙方都期待著,在不久以后能用上自己國家鑄造的“好槍”,取得更多更大的成果。
                             
                            轉載自 《中國科學報》 (2013-11-22 第7版 學人)
                             
                                                                                                                                                                                  
                              
                              
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