科技處4月9日(星期三)講座通知
學術報告
報告題目:利用高頻reads分析線狀基因組的末端
Characterization of termini of linear genome with high frequency reads
報告人: 童貽剛 研究員
軍事醫學科學院微生物流行病研究所
主持人: 陳 非
時 間:2014年4月9日(星期三)上午10:00-11:30
地 點:中國科學院北京基因組研究所1層報告廳
報告摘要: 大部分病毒(尤其是噬菌體)都具有線狀基因組,了解這些基因組的末端序列特點對于闡明這些病毒的復制機制、包裝機制以及病毒的生命周期具有重要意義。由于這些病毒基因組往往具有末端冗余(正向重復),導致在序列拼接時總是形成一個環狀的基因組序列,無法判斷基因組的起始和終止位點的真正位置,因此必須用復雜的試驗來確定基因組的起始和終止位置。本研究利用高通量測序數據,在完成病毒基因組全序列拼接的同時,通過分析測序數據中的高頻reads,直接確定基因組的上下游末端序列,獲得了數十株病毒的末端序列。同時為了證明此方法的可靠性,我們在病毒基因組末端人工連接接頭,然后進行序列測定,所獲得的結果與我們預期的結果完全一致。結論:本研究利用高通量測序數據,在拼接全基因組的同時直接確定病毒基因組的末端序列,為病毒基因組分析提供了額外的信息。
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