近日，中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心) 楊瑩、楊運桂、韓大力和張維綺以共同通訊作者在Cell Proliferation 雜志上發表了題為“m⁶A promotes planarian regeneration”的研究論文。這項研究利用MeRIP-seq及scRNA-seq技術，繪制了地中海渦蟲再生過程中的RNA m⁶A修飾圖譜和單細胞轉錄組圖譜，揭示m⁶A 修飾調控渦蟲再生機制。  

　　在本研究中，合作團隊發現m⁶A甲基轉移酶復合物在渦蟲再生過程中上調，且m⁶A修飾水平在渦蟲再生過程中呈現動態變化。此外，還發現敲低m⁶A甲基轉移酶調節亞基wtap，會導致m⁶A水平急劇下降，并抑制渦蟲再生。通過多組學數據分析發現，m⁶A修飾基因與信號傳導和細胞通訊等相關通路相關，并發現wtap敲低后造成渦蟲細胞周期異常，M期細胞的百分比顯著增加，且細胞周期蛋白依賴性激酶7 (cdk7) 和細胞周期蛋白依賴性激酶 9 (cdk9)的表達上升。進一步發現雙重敲低wtap與cdk7或cdk9，可部分挽救wtap單敲導致的再生受阻表型，表明wtap可能通過調節細胞周期相關基因的表達調控渦蟲再生。通過分析敲低前后的單細胞轉錄組數據，發現神經元細胞比例在wtap敲低后下降，通過亞型解析發現了一類wtap敲低后產生的獨特的神經祖細胞樣細胞亞型（NP樣細胞），并鑒定到該亞型的主要標記基因grn和ubiqp。進一步觀察雙敲wtap和grn的渦蟲的表型，發現雙重敲低在一定程度上顯著挽救了渦蟲再生受阻表型；雙重敲低grn、cdk7或cdk9與wtap，會導致NP樣細胞亞型比例減少，表明wtap介導的m⁶A通過調控grn表達，進而影響渦蟲再生。 

　　綜上所述，該研究解析了地中海渦蟲中wtap敲低前后的組學特征變化，并通過構建渦蟲基因敲低系統，發現m⁶A甲基轉移酶調節亞基WTAP通過調節細胞周期及細胞間通訊基因的表達從而調控渦蟲再生的機制，并發現wtap敲低誘導產生了一類獨特的神經祖細胞類細胞亞型。 

　　該研究得到了來自中國科學院、國家自然科學基金委和科技部等項目的資助。

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m⁶A通過WTAP介導調控渦蟲再生