國家基因組科學數據中心發布數據資源整合挖掘體系
近日,國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表題為“Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020”的文章,以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建設方面的布局與現狀。
國家基因組科學數據中心依托中科院北京基因組研究所建設,由中科院生物物理所和上海營養健康所共建。在前期數據資源建設基礎之上,從數據、信息、知識三個層次系統展示了面向人口健康和重要戰略生物資源的生物大數據匯交共享平臺和多層次資源體系。此次,國家基因組科學數據中心發布了基因組變異與表型關聯、微生物分類與基因組資源、表觀組關聯分析、特色物種多維組學信息資源等8個新開發數據庫,系統更新了原始測序數據歸檔庫GSA、基因組歸檔數據庫GWH、基因組變異數據庫GVM、非編碼RNA等15個資源庫,并對云分析等4個網絡服務工具進行了更新優化。
國家基因組科學數據中心免費向國內外用戶提供方便快捷的多組學數據匯交和存儲服務,目前,已匯交來自269個單位720個用戶遞交的超過1.4PB的組學數據,相關數據發表于144種國內外期刊的237篇文章。GSA已被國際著名出版商Elsevier收錄為指定的基因數據歸檔庫。此外,通過跨庫檢索形式,中心還整合了13家國內合作科研機構的25個專業特色數據庫,極大豐富了數據資源類型。
該研究得到科技部、中國科學院、國際生物科學聯合會等的資助。
國家基因組科學數據中心核心數據資源
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