近日，由中國科學院北京基因組所與中國科學院計算生物學重點實驗室、北京生命科學研究院等多家單位組成聯合攻關團隊，合作開發的生物進化與多組學綜合分析軟件eGPS 1.0 正式在線發布。該項研究成果以“EGPS 1.0: Comprehensive software for multi-omic and evolutionary analyses”為題于6月18日在線發表于National Science Review。eGPS1.0收集了生物進化與多組學分析領域的主要軟件與可視化工具，為全世界從事生物進化與多組學分析的科研人員提供免費的分析平臺。 

　　隨著二代測序成本的不斷降低以及三代、四代測序技術的快速發展，越來越多生物物種的全基因組序列被解讀出來，多組學數據呈現爆發性增長的態勢。然而，數據的高效挖掘和深度解析卻是生物學家面臨的又一難題。該研究開發了進化基因型-表型系統（eGPS）的多功能軟件，使用戶能夠進行全面的多組學和進化分析。 

　　eGPS軟件包括單機軟件版本eGPS Desktop和云計算eGPS Cloud，能夠在不同平臺下運行，且利于開發，易于應用。通過eGPS Cloud，將基因組分析、群體數據分析、進化數據分析、網絡分析以及圖形可視化這五部分的分析有機整合起來，實現遠程云計算功能，方便用戶在缺乏計算資源的情況下快速獲得運算結果，并最終以圖形、圖表等形式直觀展示。通過eGPS Desktop，用戶無需上傳數據即可分析基因組學和蛋白質組學數據。同時eGPS Desktop還擁有完善的進化分析流程。比如可以直接從基因組序列比對建立物種樹。在eGPS Cloud和其他開放式在線資源的支持下，eGPS Desktop提供了一鍵點擊從候選基因到基因樹的分析流程。egps結合了云計算和桌面應用的優勢，具有用戶友好的圖形界面和高度的交互能力。 

　　該項研究得到中國科學院戰略先導項目“動物復雜性狀的進化解析與調控”的支持。 

 　　eGPS Cloud網頁界面，共包括15個軟件以及20個可視化工具