北京基因組所生命與健康大數據中心開發系列特色科學數據庫
近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇數據庫文章在國際學術期刊核酸研究Nucleic Acids Research(NAR)雜志在線發表,并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas、犬類數據庫iDog、RNA編輯與疾病相關知識庫EDK、植物RNA編輯數據庫PED、人類長非編碼RNA數據庫LncBook、多物種全基因組核小體定位圖譜數據庫NucMap以及一篇介紹大數據中心整體資源建設進展的文章。
自成立以來,BIGD面向我國人口健康和社會可持續發展的重大戰略需求,圍繞國家精準醫學和重要戰略生物資源的組學數據,建立了針對原始數據遞交、存儲與共享的數據庫GSA,基因組變異數據庫GVM,基因組歸檔數據庫GWH,基因表達數據庫GEN,DNA甲基化數據庫Methbank,基于維基的生物學知識庫Science Wikis,大數據挖掘與分析的工具和方法的數據庫Biocode。在完成了基礎數據庫資源建設之后,又進一步開發了LncBook、EWAS、EDK、PED等一系列針對不同研究領域的專業數據庫。這些特色數據庫的建設完成將更有助于生物大數據的利用與轉化,真正實現了BIGD將數據存好、管好、用好的目標。
核酸研究期刊每年發布一次全球數據中心整體建設情況,自2016年至今,連續三年發布北京基因組所生命與健康大數據中心資源建設情況,并在今年一月的數據庫專刊中將該中心評價為國際重要數據中心之一,表明我國數據中心建設已獲得國際同行關注與認可,達到國際水準。
大數據中心資源
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