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                            國際核酸研究雜志2018數據庫專刊連登四篇北京基因組所生命與健康大數據研究成果

                              2018年1月4日,國際核酸研究(Nucleic Acids Research)數據庫專刊,連登四篇北京基因組所生命與健康大數據研究成果,包括生命組學數據資源建設成果(D14-20)、實時定量PCR內參基因知識庫—ICG(Internal Control Genes;D121-126),甲基化數據庫Methbank升級版(D288-295)以及基因組序列變異庫—GVM(Genome Variation Map;D944-949)。四篇文章在核酸研究雜志的發表,標志著我國綜合型生物信息資源庫建設獲得國際同行進一步認可。

                              自上世紀60年代以來,國際生物信息學家建立了一系列的數據庫。特別是上世紀90年代,隨著人類基因組計劃的展開以及網絡在全球普及,數據庫數量和體量迅猛增加,形成了以NCBI、EBI、DDBJ等為代表的多個國際大數據中心。隨著測序技術不斷發展,我國已成為國際基因組數據最大產出國之一,但我國產出的組學數據絕大部分必須提交到國外數據庫才能得到認可。據Database Commons數據庫統計,我國數據庫資源總數已位居世界第二,但大部分數據庫沒有進行長期運行維護,嚴重缺乏深度人工審編,數據庫內容邊緣化,最終結果是大量數據庫資源質量不高,利用率低。

                              中科院北京基因組研究所面向國家大數據發展戰略和科技創新戰略,成立生命與健康大數據中心,建立生物大數據儲存、整合與挖掘分析研究體系,構建的GSA(Genome Sequence Archive)數據庫已開展原始組學數據存儲與共享服務,并與國際接軌,存儲的數據已支持Cell、Nature Communications、PNAS、Genome Research等雜志文章發表,建成我國生物大數據匯交共享平臺,成為繼NCBI、EBI、DDBJ之后第四個綜合基因組權威數據庫。同時,還建成了生物大數據多層次組學層面的數據資源體系,包括基因組歸檔數據庫Genome Warehouse、基因組變異數據庫Genome Variation Map、基因表達數據庫Gene Expression Nebulas、甲基化數據庫Methylation Bank、生物知識庫Science Wikis,對我國科學研究和產業創新發展起到了重要支撐作用。

                              該研究得到國家重點研發計劃、國家自然基金委、中國科學院戰略性先導科技專項、中國科學院國際大科學計劃等項目基金的資助。

                             

                              

                              

                              

                              

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