2013年第6期Genomics, Proteomics & Bioinformatics（GPB）紙質版期刊已經出版，共發表文章6篇，包括4篇研究性文章，1篇快報和1篇方法學文章。

　　先兆子癇是指孕婦在懷孕期間，發生血壓上升（妊娠型高血壓），合并蛋白尿、水腫等現象。研究表明，先兆子癇女性所生女兒罹患乳腺癌的風險降低，但機制尚不清楚。Chung-Cheng Hsieh博士（美國）等采用血漿NanoUPLC-MSE蛋白質組分析方法，比較了先兆子癇孕婦和正常孕婦臍帶血數據，發現了包括甲胎蛋白在內的多種差異表達的蛋白，這為深入研究先兆子癇與乳腺癌易感性的關系提供了新的思路。

　　基因組和后基因組技術的飛速發展使我們可以很容易獲得大量數據信息，但還需要生物學知識來幫助我們更好地認識相關復雜機制，如了解植物的免疫應答機制可幫助人們高效地進行作物生產經營。Liliana López-Kleine博士（哥倫比亞）等利用現有擬南芥和木薯基因組數據，采用微陣列和RNA-seq相結合的整體分析方法研究了免疫相關基因與其他基因在調控網絡中的相互關系，并預測了一些新的免疫相關基因，該方法為免疫應答研究提供了有利的依據證明。

　　為了進一步闡明microRNA在肝癌中的作用，Mahmoud ElHefnawi博士（埃及）等采用新的生物信息學方法對26種肝癌細胞的miRNA進行了目標預測和功能分析，同時還揭示了肝癌致癌信號通路的關系，通過綜合分析表明miRNA可分類為腫瘤抑制或腫瘤促成miRNA； 因此一些miRNA可作為治療靶標，而另一些則可作為治療劑，miRNA的這一雙重角色也正表明了其在細胞自動調節中的積極作用，為microRNA在腫瘤中的作用研究提供了可行的研究方法。

　　基因組學與蛋白質組學是生物醫學研究的主要技術，Nichole Reisdorph博士（美國）等通過提供短期的實踐操作培訓課程，為研究者們提供了很好的學習和鍛煉的機會。該培訓包括講座、實驗室操作、視頻演示、軟件操作等等，文章主要就課程細節及參加者對課程的評估進行了描述，證明該培訓對研究者申請基金、發表文章都是非常有益的。

　　陰道毛滴蟲的翻譯起始因子eIF5A（TveIF5A）被廣泛認為有羥腐胺賴氨酸、磷酸化及糖基化修飾，已有3個不同的亞型（pI5.2、pI5.3和pI5.5）被報道。María Elizbeth Alvarez-Sánchez博士（墨西哥）等認為不同TveIF5A亞型與其磷酸化修飾有關，于是利用質譜分析法鑒定了這些亞型的磷酸化位點并證明了他們的假設。研究同時表明內源酪蛋白激酶2可能參與了TveIF5A磷酸化修飾。

　　真核生物的蛋白質運輸和分選是一個復雜的過程，目前有許多方法利用序列信息來預測蛋白的亞細胞定位。在以往平面或平行結構預測的基礎上，Geetha Govindan博士（印度）等介紹了一種利用集成分類器進行蛋白分選分層預測的方法——Bagging with CTD, 經實驗驗證并與現有方法比較分析，證明該方法精確度高，在獲取蛋白質分泌途徑的生物學特性研究中可起到十分有效的作用。

　　以上文章全文可在GPB主頁 或ScienceDirect數據庫中瀏覽下載，歡迎大家閱讀、引用。

　　另外，GPB將在今年4月出版“Ribogenomics”的專刊，由主編于軍博士親自擔任Guest editor，歡迎大家積極投稿。

　　附：本期目錄

　　Original Research 

　　Screening Preeclamptic Cord Plasma for Proteins Associated with Decreased Breast Cancer Susceptibility 

　　Identification of Immunity-related Genes in Arabidopsis and Cassava Using Genomic Data 

　　An Integrative Meta-analysis of MicroRNAs in Hepatocellular Carcinoma 

　　Hands-on Workshops as An Effective Means of Learning Advanced Technologies Including Genomics, Proteomics and Bioinformatics 

　　Letter 

　　Identification of the Phosphorylated Residues in TveIF5A by Mass Spectrometry 

　　Method 

　　Bagging with CTD - A Novel Signature for the Hierarchical Prediction of Secreted Protein Trafficking in Eukaryotes