基因組所章張研究員對長非編碼RNA分類問題進行系統綜述
近日,中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室章張團隊,與沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)開展科研合作,對長非編碼RNA的分類問題進行了系統綜述,相關論文在《RNA Biology》中發表。
長非編碼RNA是近期發現的一大類非編碼RNA(長度普遍大于200nt,故籠統稱之為長非編碼RNA)。其在細胞內普遍轉錄并大量存在,并在多個生命過程中發揮重要作用。
根據目前所得數據,長非編碼RNA缺乏顯著序列特征,與蛋白編碼RNA及miRNA相比較,其物種間序列保守性較差,嚴重阻礙了大規模生物信息學及功能研究。為促進長非編碼RNA的生物學特征及生物學意義的研究,研究人員從基因組位置、對DNA序列的影響、功能分類、與靶基因結合特征等不同方面探討了長非編碼RNA的分類,并研究了不同分類方法之間所存在的聯系。
長非編碼RNA的準確分類將對某一類特定長非編碼RNA的研究、在不同類別的長非編碼RNA上提出假設及挖掘長非編碼RNA功能等方面提供有力的幫助與借鑒,因而在長非編碼RNA的研究上具有重要意義。
文章鏈接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23696037
人類和小鼠的長非編碼RNA長度分布
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