中-沙椰棗基因組葉綠體分析完成相關論文在PLoSONE發表
2010年8月,由中科院北京基因組研究所(簡稱:基因組所)與沙特王國阿卜杜拉阿齊茲國王科技城(沙特王國的國家科研管理機構和國家科學研究機構King Abdulaziz City for Science and Technology,KACST)共同開展的“中-沙椰棗基因組計劃”取得階段進展,科研人員于近日完成了椰棗基因組葉綠體的基因組測序與分析工作,相關學術論文在PLoSONE雜志發表。
自2008年底該項目啟動以來,基因組所不間斷地向沙特國王科技城(KACST)派駐了十余名科研骨干,根據前期合作要求,一年多來,在雙方的共同努力下,科研人員已經在KACST建立起了一整套基因組和生物信息學實驗平臺。此次完成的椰棗葉綠體基因分析即由該平臺親自獨立完成,其主要是利用新一代454高通量測序儀產出數據,篩選出葉綠體數據,并借助SOLiD Mate-pair數據進行拼接和分析。
同時,該篇學術論文的發表,是“中-沙”兩國椰棗項目合作組成立以來發表的第一篇學術論文,它標志著基因組所與KACST(沙特國王科技城)共建的基因組測序與信息平臺已經高速運轉,并產出高質量的數據和分析結果。這也是國際上首次發布椰棗的葉綠體基因組數據,對植物,特別是棕櫚科植物的進化模式研究具有十分重要的意義。同時也對后續椰棗基因組的拼接和分析起到積極意義。
論文鏈接:http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0012762
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