2009年第3期《基因組蛋白質組與生物信息學報》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)重點關注了幾種致病微生物的相關研究。其中，我所胡松年研究組的張國強等運用新方法對結核桿菌(Mycobacterium tuberculosis)蛋白進行篩選和檢測以區分結核病人和卡介苗接種者，取得了良好效果。四川大學鮑錦庫研究組根據水平基因轉移的理論運用生物信息學方法對稻瘟菌(Magnaporthe grisea)的感染機制進行了分析，并發現了某些可能的水平轉移基因。伊朗Shiraz大學的Hassan Mohabatkar等對利什曼原蟲(Leishmania major)的10種半胱氨酸蛋白酶序列做了生物信息學分析，為疫苗研發提供了有益幫助。印度的K. Natarajaseenivasan等用系統發生方法分析了鉤端螺旋體(Leptospira)外膜脂蛋白編碼基因ompL1, lipL32和lipL41的抗原變異性，發現了某些特定差異，對相關疫苗的研發將起到重要作用。

此外，本期還發表了我所基因組科學與信息重點實驗室的王大鵬等對替換率變量影響非同義替換率(Ka)和同義替換率(Ks)計算的研究成果，希臘的Pantelis G. Bagos等對膜蛋白結構預測的研究，以及兩款生物信息學的應用軟件。

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附：本期目錄

In silico analysis of the potential infection mechanisms of Magnaporthe grisea from horizontal gene transfer hypothesis 　　　　　　　　　　　　  　　 　P77-86

Computational analysis of cysteine proteases (clan CA, family C1) of Leishmania major to find potential epitopic regions　  　 　　　　　 　　　　　　　P87-95

Evolutionary implication of outer membrane lipoprotein-encoding genes ompL1, lipL32 and lipL41 of pathogenic Leptospira species　　　　　　　　　　P96-106

Screening and assessing 11 Mycobacterium tuberculosis proteins as potential serodiagnostical markers for discriminating TB patients from BCG vaccinees

P107-115

How do variable substitution rates influence Ka and Ks calculations? 　 　P116-127

How many 3D structures do we need to train a predictor? 　 　　　 　 P128-137

PBOND: web server for the prediction of proline and non-proline cis/trans isomerization　  　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　P138-142