中華絨螯蟹血液表達譜分析文章發表
2009年2月，中科院北京基因組研究所基因組科學及信息重點實驗室與華東師范大學生命科學學院合作的研究成果，“Discovery of immune-related genes in Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) by expressed sequence tag analysis of haemocytes” 論文在《Aquaculture》雜志上發表。
甲殼動物養殖在全世界水產養殖業中占有極其重要的地位，2004年，在世界水產品生產總值中，甲殼動物總重量雖僅占6.19 %（約3.68 百萬噸），但總價值中卻占到了20.4 %（約1.44 百億美元）。中華絨螯蟹俗稱河蟹，是中國著名的淡水蟹，具有重要的經濟價值，從80年代以來河蟹養殖業發展迅速，已成為水產養殖支柱產業之一。伴隨著養殖業的迅猛發展，甲殼動物的病害也呈上升趨勢，在河蟹眾多病害中，顫抖病是最為常見、危害最為嚴重的一種。此暴發性疾病往往造成嚴重的經濟損失,死亡率達70%以上。它的病害防治，至今仍是水產界面臨的難題之一。甲殼動物缺乏特異性的免疫系統，它們的免疫防御主要由細胞和體液免疫系統所組成，通過血細胞或淋巴細胞的吞噬、包囊作用排除異己的微生物和病原體。抗菌肽(antimicrobial peptide，AMP)作為其中一種免疫因子在生物中廣泛存在，它是在外界條件刺激下，生物免疫防御系統產生的一類對抗外源性病原體致病作用的具有免疫活性的多肽物質，是脊椎動物、無脊椎動物和植物先天性免疫的關鍵因子。而在淡水種類如中華絨螯蟹中還未見相關報道。為了充分鑒定河蟹的免疫相關的基因，發現潛在的抗菌肽，提高蟹體自身免疫能力，我們與華東師范大學合作，以其血液為材料，利用EST分析的手段對其轉錄組進行了研究。
科研人員對樣品隨機測序（5’端）3118條，一共得到3041條高質量的EST序列，并最終得到1039條unigene（319條contig和720條singleton）。通過與公共數據庫內的序列進行比對，總共注釋了488（47%）個基因。通過基因表達豐度和功能分析（主要是GO和KAAS），對其基因表達譜特征有了全面的認識。其中與免疫相關的基因共鑒定到26個基因，根據其功能主要分為五類——抗菌肽、酚氧化酶系統、超氧化物歧化酶系統、凝結系統和模式識別分子。主要的免疫因子為Kazal-type proteinase inhibitor和the C-type lectin，我們還鑒定到三種潛在的抗菌肽分子，為之后克隆其全長基因序列并研究功能奠定了基礎。
相關結果在，《Aquaculture》上發表
Aquaculture 2009; 287: 3-4 P297-303
Published online 2009 February 18. doi:10.1016/j.aquaculture.2008.10.050.
Zhao D, Song S, Wang Q, Zhang X, Hu S, Chen L.
Discovery of immune-related genes in Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) by expressed sequence tag analysis of haemocytes
