2018年

  血液系統惡性腫瘤發生、進展核心機制研究及分子靶向策略探討

  湖北省科學技術獎勵

  一等獎

  2018

  基于新一代測序技術的法醫基因組學研究

  2018年中國分析測試協會科學技術獎（CAIA獎）

  二等獎

  2018

  第十一屆談家楨生命科學創新獎

  

  

  2015

  第十五屆李汝祺動物遺傳獎

  

  

  2015

  天津市自然科學獎一等獎

  

  

  2013

  中國專利優秀獎

  國家

  國家

  2012

  2012年度發展中國家科學院農業獎

  國際

  國際

  2009.12

  “超級雜交水稻雜種優勢相關的潛在功能基因的發掘與鑒定”--2009中國基礎研究十大新聞

  

  

  2007.12

  “證實CASP8基因啟動子的一個六核苷酸插入/缺失多態與多種癌癥易感性相關”-2007年度中國基礎研究十大新聞

  

  

  2007-4-7

  利用EST信息資源大規模克隆家蠶功能基因--浙江省科技進步一等獎（第三單位）

  浙江省科技進步獎集體獎

  一等獎

  2006-11

  何梁何利科學與技術進步獎-生命科學獎 -楊煥明

  科學與技術進步獎

  個人獎

  2005.2

  非典型肺炎冠狀病毒基因組測序及ELISA診斷試劑盒研究--北京市科技進步獎二等獎

  北京市科技進步獎

  二等獎

  2005-4-1

  海嘯項目-五四青年 鄧亞軍

  五四青年獎

  

  2005-11-1

  SARS病原學及其防控系列研究-國家科技進步獎二等獎（第二單位）

  國家科學技術進步獎

  二等獎

  2005

  2005“北京十大杰出青年”-鄧亞軍

  其他

  個人獎

  2005

  第三世界科學院生物獎 -楊煥明

  其他

  個人獎

  2004.7

  SARS病源的發現與確證--軍隊科技進步獎二等獎（第二完成單位）

  科技進步獎

  集體獎

  2004-3

  中國雜交水稻基因組計劃--中國科學院杰出科技成就獎

  科技成就獎

  集體獎

  2003-6

  Nikkei亞洲科技獎 -楊煥明

  其他

  個人獎

  2003-3

  中國雜交水稻基因組計劃--中國科學院2001-2002年度重大創新貢獻團隊

  其他

  集體獎